Gebouwd met traditionele materialen voor een lage impact op het milieu. Elke hut heeft een eigen terras met uitzicht op het omliggende bos en zijn rijke (vogel) leven. De eigen badkamer heeft een volledig uitgeruste badkamer met een wastafel, een douche en een apart composteertoilet.

Voor grotere groepen biedt Budongo Eco Lodge vier comfortabele slaapzalen, elk met twee dubbeldekkers. De stapelbedden zijn voorzien van een klamboe. Naast de slaapzalen bevindt zich een gemeenschappelijke douche- en toiletgebouw met warm en koud stromend water.