Construit avec des matériaux traditionnels pour un faible impact environnemental. Chaque cabine dispose d'une terrasse privée qui surplombe la forêt environnante et sa riche vie (oiseaux). La salle de bains privative est entièrement équipée avec une table de lavage, une douche et des toilettes séparées à compostage.

Pour les plus grands groupes, le Budongo Eco Lodge propose quatre dortoirs confortables, chacun doté de deux étages. Les lits superposés sont équipés d'une moustiquaire. Adjacent aux dortoirs se trouve une douche commune et un bloc de toilettes avec de l'eau courante chaude et froide.