Originalmente un seminario, el Museo de la Catedral Mdina se encuentra al otro lado de la calle en el lado de la catedral al sur en Mdina. Hoy en día, este es uno de los museos religiosos más destacados de Europa. En el segundo piso se encuentra una pequeña capilla que exhibe vestimentas de la iglesia. También exhibe una impresionante sección transversal de arte sagrado, pinturas famosas, una colección de monedas, antigüedades romanas y documentos originales de la época de la Inquisición.