Il Pantanal Norte, situato a sud della capitale Cuiabá, è composto da pianure alluvionali che ospitano alligatori, capibara, tapiri e varie specie di uccelli, tra cui il famoso Tuiuiú, uccello simbolo della regione. Le destinazioni principali sono il Barão de Melgaço, che ha savane, Poconé e Cáceres, che hanno zone di accesso difficili a causa dei lunghi mesi di inondazioni.