La mezquita de Rustem Pasa fue construida por el famoso Gran Vizier y yerno de Suleyman el Magnífico Rustem Pasha, el marido de Mihrimah Sultan. La mezquita fue diseñada por Sinan y es una de las mejores mezquita pequeña de la ciudad. El estilo utilizado en esa mezquita es muy diferente de la simplicidad de Sinan y de ese período.

La mezquita de Rustem Pasa sufrió daños en un incendio en 1660. Después del terremoto de Estambul en 1776, tanto el minarete como la cúpula de la mezquita llegaron al suelo. Fue renovado, pero durante la renovación, la cúpula y el minarete en ruinas se quedaron por debajo de la realidad de la estructura de Sinan el Arquitecto.