An der Mole, unterhalb des Swakopmunder Leuchtturmes, stellte die Stadtverwaltung Swakopmund ein Grundstück mit der Ruine des ehemaligen Kaiserlichen Hauptzollamtes zur Verfügung. Das zunächst „Kulturzentrum“ genannte Gebäude, das neben dem Museum eine öffentliche Bücherei und eine Lesehalle beherbergte, wurde am 5. März 1960 eröffnet.

Die Schwerpunkte der Ausstellungen liegen auf der Geschichte und Natur der namibischen Küstenregion und der Heimatgeschichte der Stadt Swakopmund.

Besonderer Anziehungspunkt ist die Originaleinrichtung der berühmten Swakopmunder Adler-Apotheke, sowie eine umfangreiche Ausstellung über die ethnischen Gruppen Namibias, ein originaler Ochsenwagen, diverse Dioramen zu geschichtlichen Ereignissen in Namibia sowie eine umfangreiche Sammlung namibischer Insekten.