Lamu Island heeft een van de beste koraalriffen in Kenia. Het meest opvallend zijn de riffen van Manda Toto, Kiniyka en bij Kiunga Marine National Reserve, waar de grillige en gracieuze vormen van het koraal worden afgewisseld door de kleurige strepen en patronen van de tropische vissen die in het rif leven. Naast vissen, zijn dolfijnen en zeeschildpadden ook frequente bezoekers van de wateren bij Lamu. De duikindustrie is nog weinig ontwikkeld in deze archipel, dit komt door de afgelegen ligging, het gebrek aan goede personeel en materiaal. U kunt er echter uitstekend snorkelen, dhows en gemotoriseerde boten brengen u naar de omliggende tropische riffen, welke nog vaak ongerept en in takt zijn omdat nog maar weinig snorkelaars en duikers het gebied bezoeken.
